Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00323 LG1 5866131 5868324 protein brassinosteroid insensitive 1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, protein phosphorylation, protein phosphorylation, positive regulation of secondary growth
Cellular Component   located in   plant-type cell wall
Molecular Function   enables   kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 5866283 missense_variant p.Cys496Phe
C/A 5866290 missense_variant p.Ala494Ser
G/A 5866550 missense_variant p.Ser436Phe
G/A 5866830 downstream_gene_variant
A/G 5866855 downstream_gene_variant
T/C 5867416 synonymous_variant p.Lys303Lys
T/G 5867867 missense_variant p.Asn153Thr
T/C,* 5868198 missense_variant p.Ile43Val
A/C 5868200 missense_variant p.Met42Arg

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00323.1
MADIASNSCINILYLITKKLAMKFYFPRVHPFLFMVLILCPMIFADLNSDKQALLDFAASVPHRRDLKWNSATSICTSWVGVTCNLNGTRVVSLRLPGIGLVGTIPANTLGKIDSLRNLSLRANLLSGSLPPDISSLPSLQYLYLQHNNLSGNIPTSLSTHLNVLDLSYNSFTGAIPKTLQNLTQLTRLNLQNNSLSGEIPNLNVTKLRHLNLSYNHLNGSIPAALQTFPNSSFEGNSLCGLPLRPCSVAPPASPPSLTPAPPTPSRHKSKLSKAAIIAIAVGGGVLLLLVALIIVLCCLKKKDDGSPRPTKGKGPSGGRTDKPKEEFGSGVQEPEKNKLVFFEGSSYNFDLEDLLRASAEVLGKGNRASGRTPLDWNSRIKISVGIARGIAHVHSVGGPKFTHGNVKSSNVLLNQDNDGCISDFGLTPLMNVPATPSRAAGYRAPEVIETRRDDVVDLPRWVQSVVREEWTAEVFDVELMRYQNIEEEMVQMLQIAMACVAKVPDMRPTMEEVVRMIEEIRQSDSENRPSSEENRSKEESTAQTP*


CDS Sequence:
>Vu_00323.1
ATGGCAGATATTGCTTCAAATTCATGTATCAATATCTTATACCTTATCACCAAAAAACTTGCCATGAAGTTCTACTTCCCTCGAGTGCATCCTTTCCTTTTCATGGTTCTTATTCTCTGTCCTATGATTTTTGCTGACTTAAATTCTGATAAGCAAGCCCTTCTTGATTTTGCTGCTTCTGTCCCCCATCGCCGTGACCTAAAGTGGAATTCAGCTACTTCAATTTGTACATCTTGGGTAGGTGTCACTTGCAATCTAAATGGCACCCGTGTTGTTTCTCTCCGGCTTCCTGGAATTGGACTTGTCGGCACCATTCCGGCCAATACACTTGGCAAGATTGACTCACTCAGAAATCTCAGCCTCCGTGCCAACCTACTCAGTGGAAGTCTTCCTCCTGATATTTCTTCTCTTCCTTCTCTACAATATCTTTACCTTCAGCATAATAACCTTTCTGGTAACATACCTACCTCACTGTCCACCCACCTCAATGTACTTGATTTGTCATATAATTCCTTCACCGGTGCTATTCCAAAGACATTGCAAAACTTAACACAACTAACTAGGTTGAACCTCCAGAACAACTCCCTATCTGGTGAGATACCAAATCTCAATGTCACAAAGCTCAGGCACTTGAATTTAAGCTACAACCATTTGAATGGCTCTATCCCTGCTGCTCTTCAGACTTTCCCCAATTCTTCCTTTGAGGGTAACTCTCTATGTGGATTACCTCTAAGGCCATGCTCTGTAGCCCCCCCTGCATCTCCTCCATCATTAACTCCTGCCCCACCAACTCCTTCAAGACACAAAAGTAAATTGAGTAAGGCAGCTATCATTGCAATTGCAGTTGGTGGGGGTGTGCTATTACTTTTAGTAGCTCTCATCATTGTTCTTTGCTGTTTAAAGAAAAAAGATGATGGAAGCCCCAGACCTACTAAAGGCAAGGGTCCTAGTGGTGGGAGAACTGACAAACCAAAAGAAGAGTTTGGAAGTGGGGTGCAAGAACCTGAGAAGAACAAGTTGGTTTTCTTTGAAGGCAGTTCTTATAATTTTGATCTAGAGGATTTGCTGAGAGCTTCGGCTGAAGTTCTTGGAAAGGGTAACAGAGCAAGTGGAAGAACTCCATTAGATTGGAACTCCCGAATAAAAATATCTGTTGGAATTGCCAGAGGAATTGCTCACGTACATTCAGTTGGCGGTCCAAAATTCACTCACGGAAATGTGAAATCTTCAAATGTCCTCCTCAACCAAGATAACGATGGCTGCATCTCTGACTTTGGCCTGACCCCATTAATGAATGTTCCTGCAACTCCTTCTAGAGCTGCAGGCTATCGCGCCCCTGAGGTGATTGAAACGCGACGTGACGATGTGGTCGATCTCCCAAGGTGGGTGCAATCTGTTGTTAGGGAGGAGTGGACAGCTGAGGTTTTTGATGTTGAGCTAATGAGGTACCAAAACATTGAAGAAGAAATGGTGCAAATGTTGCAAATTGCCATGGCCTGTGTGGCAAAGGTTCCAGATATGAGGCCCACCATGGAGGAAGTAGTGAGAATGATTGAAGAAATCCGGCAATCCGACTCCGAAAACCGGCCATCTTCGGAAGAGAATAGATCCAAGGAGGAATCAACTGCTCAGACTCCATAA


Promoter Sequence:
>Vu_00323::LG1:5868324-5870324(-)
TCACTTCTTCTTCTAGCTCCTATAGTAGCCTCAACCTCAACGCCTTCCATTTTCATGCAAATTCTCTGTGGTGTTGAGCTTTCATGCCCCAATTGAGAGCTACGCTGATTGAAATTCTCTATTATTTGTTACTTACTTCAGAATCTGAAGCACAGTACAAGTCTGCAACTAGCTCAGCTTCTTCAGTGTGAATGCGTCATCTCGCCCTGTGGTTTAAGCTCTGAGCTGTTCCATGAATCCTTGTGCTTCTTCCTCTTTGCTTTCCTTCAGGTGATTACTCATTGAAAAATCACCCCTTTCTTTGTCCCTGCGTGCTAACTTGTGCTAGTAACTTAGTTTGCAGATCTGGGGTGTTTTGGTTTAGTGGTTTTCATGGGTGCCCACTTATGGGCTTCGAACTATCAAACGGGTTCCACATTGTGGGTTGGGTTTCCAAGGATGTACTTGACAGGGAGTTTTGGGGTTTATTTCTGGTGCTAGTGCTTGGTGTTTTTCTTCTTCACGTGGGGTGTGACTTCTTAATGAGGGAAACTCTTGGGGTGTTTTGGTTCAGTGCTAGTTTGCAGATCTGGGATGTTTTGGTTCAGTGGTTTTCATGAATACCCACTAATGGGCTTCAAACTATCAAATGGGTTGCACATTGTGGGTTGGGTTCCGAAGGATGTGCTTCAAAGGGAGTTTTGAGGTTTCTTTCTGGTGCCAGTGCTTGGTGTTTTTCTTGTTGATGTGCGGGTGTTACTTCTTAATGGTGGGAACTCTTGGGATTTTGTTTTTATTTTGTGTTAGATGTTTTTGTTTTTAGTTGTTGTTTTGATGAAAGTTTAGTTGTTGAACAACTTTGACTGTCAGTGGTCTTTTAATTTCCTTCCCAATACATTAAATATGGTATGTGAACAAAATTTGGGTTAATAATTCGTCCATCTGTATTCAATGTAGAAATTCGGGTAGTTCCTCTTCCGTGCAGGAAAAAAAAGGCAGGAAGGAAGCTTACATTGTTTCTTTCTGGTTGGCAAGATAATCTGTTCTGAGAATTAACTGCAGAAATGTTAGTTCGAGCTATAAAGGCACAAGAAAGCTAAATTACCTACTCCAACAACTTAATTTGACAGTAAATGTTGTTTTTGAGTTCTTTCATATTCCTCTTCAGCTAAAATCCTGGGATTCTTTTTCTTTTGGGGTTCATCTACTTGGCTTTCTAATGGGACCTTTTGTTGAAAAGCTTCTGTCTCTCAAAAATGGTTAATGTTCCAGCCAGTTGATTAATGACTTTATACTAATTAAGGAGGAATTTGTTATTTCATAGACCAAACATTTTCCTTTTCCTTCCTGAGCAAGCTGTCTTAACATATTCAATTTTGTAGTCATCTTCTTCACTGCTCATTTCTCTTTGTCATTGATTTGCAGCTATGCTTTAGGTATGAGCATTGCTTGTTTCAACTGTAACTTGAATATTCTCCTAGTGGGTATAGTTGTCATTCGATATCTTTTAATATCCACTGTTGAAAACTGAAAATGATGCTATTGCTTTCGTTCAACATCATGTAATAGTTCTTTTTTATTTTCATTTTTGTCACTTATTCCTAGTTACGCTAGGCAAGGATTGTGACTGATGTATATACCCTGCTCCAAGAGGCATGTTTTCATTAGGTTACTGTTGTTCAGTTGTTTGTGATTGTTACTCTACAAAGTTGAAGCTGCATTAGGCATTTTTAAAATATTAAGTATGTTTCTGATATTAAGTATTTTTTGTAAGCTCAAAAGGTTTATTCCTCCATTAGATCCCTGATGGTAATGGAAATCTTACAACAAGAAAAAAGAGATTGCAAGATCTTATTCAGAGCTTGCAACTACCTTAATATTTATTGGTTGATTCAGTCAGATGTGCCTTTTAGTTAACTAGAACTATCTGTGTCATTATAATTGATAGTGCTTGCTTCTTTATGCTATTGTATTCTAACTATGATTTGTGGTCATGGTGCTAAACCAGGAAAATATGAAGG


Gene Sequence:
>Vu_00323(-)
ATGGCAGATATTGCTTCAAATTCATGTATCAATATCTTATACCTTATCACCAAAAAACTTGCCATGAAGTTCTACTTCCCTCGAGTGCATCCTTTCCTTTTCATGGTTCTTATTCTCTGTCCTATGATTTTTGCTGACTTAAATTCTGATAAGCAAGCCCTTCTTGATTTTGCTGCTTCTGTCCCCCATCGCCGTGACCTAAAGTGGAATTCAGCTACTTCAATTTGTACATCTTGGGTAGGTGTCACTTGCAATCTAAATGGCACCCGTGTTGTTTCTCTCCGGCTTCCTGGAATTGGACTTGTCGGCACCATTCCGGCCAATACACTTGGCAAGATTGACTCACTCAGAAATCTCAGCCTCCGTGCCAACCTACTCAGTGGAAGTCTTCCTCCTGATATTTCTTCTCTTCCTTCTCTACAATATCTTTACCTTCAGCATAATAACCTTTCTGGTAACATACCTACCTCACTGTCCACCCACCTCAATGTACTTGATTTGTCATATAATTCCTTCACCGGTGCTATTCCAAAGACATTGCAAAACTTAACACAACTAACTAGGTTGAACCTCCAGAACAACTCCCTATCTGGTGAGATACCAAATCTCAATGTCACAAAGCTCAGGCACTTGAATTTAAGCTACAACCATTTGAATGGCTCTATCCCTGCTGCTCTTCAGACTTTCCCCAATTCTTCCTTTGAGGGTAACTCTCTATGTGGATTACCTCTAAGGCCATGCTCTGTAGCCCCCCCTGCATCTCCTCCATCATTAACTCCTGCCCCACCAACTCCTTCAAGACACAAAAGTAAATTGAGTAAGGCAGCTATCATTGCAATTGCAGTTGGTGGGGGTGTGCTATTACTTTTAGTAGCTCTCATCATTGTTCTTTGCTGTTTAAAGAAAAAAGATGATGGAAGCCCCAGACCTACTAAAGGCAAGGGTCCTAGTGGTGGGAGAACTGACAAACCAAAAGAAGAGTTTGGAAGTGGGGTGCAAGAACCTGAGAAGAACAAGTTGGTTTTCTTTGAAGGCAGTTCTTATAATTTTGATCTAGAGGATTTGCTGAGAGCTTCGGCTGAAGTTCTTGGAAAGGGTAGTTATGGTACTGCATATAAGGCTATATTAGAAGAGTCAACAACAGTTGTAGTGAAAAGGTTGAAGGAAGTCGTGGTTGGCAAAAGGGAATTTGAACAGCAGATGGAGATTGTGAGAAGAGTTGGACAGCACCCAAATGTTGTGCCACTTCGAGCTTACTATTATTCCAAGGATGAGAAGCTTTTGGTTTATGACTACATCCCAAATGGCAATCTATCAACCCTCTTGCATGGTATGCATTTCTGTTTCTCTTGTTTCAGTTAAAACTTCTAAACTTGTTTTAGTTTTCCTTTATTATGTATTTGAGTTTATACATATTACACATGAATTTTACGTATACATAGTGTTGAACTTCATGATATTTGAATGTCTTTTGGATAATCTCATTTTCTATACCTGTGGATGTTATTCAACTTCTTATGGTATATGTACATGAGTTAAATTGGATCTGAATTCGGTGACAGGTAACAGAGCAAGTGGAAGAACTCCATTAGATTGGAACTCCCGAATAAAAATATCTGTTGGAATTGCCAGAGGAATTGCTCACGTACATTCAGTTGGCGGTCCAAAATTCACTCACGGAAATGTGAAATCTTCAAATGTCCTCCTCAACCAAGATAACGATGGCTGCATCTCTGACTTTGGCCTGACCCCATTAATGAATGTTCCTGCAACTCCTTCTAGAGCTGCAGGCTATCGCGCCCCTGAGGTGATTGAAACGCGTAAGCACTCTCACAAGTCAGATGTCTACAGTTTTGGTGTTCTCCTTCTGGAAATGCTGACCGGAAAAGCCCCGCAACAGTCTCCAGGACGTGACGATGTGGTCGATCTCCCAAGGTGGGTGCAATCTGTTGTTAGGGAGGAGTGGACAGCTGAGGTTTTTGATGTTGAGCTAATGAGGTACCAAAACATTGAAGAAGAAATGGTGCAAATGTTGCAAATTGCCATGGCCTGTGTGGCAAAGGTTCCAGATATGAGGCCCACCATGGAGGAAGTAGTGAGAATGATTGAAGAAATCCGGCAATCCGACTCCGAAAACCGGCCATCTTCGGAAGAGAATAGATCCAAGGAGGAATCAACTGCTCAGACTCCATAA