Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00287 LG1 5386500 5389218 PREDICTED: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 10-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, signal transduction, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   nucleus
Molecular Function   enables   protein binding, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein serine/threonine kinase activity
SNP Position Effect Amino acid change
G/C,A 5388507 missense_variant p.Asp323Asn
A/G 5388545 synonymous_variant p.Gly335Gly
G/A 5388566 synonymous_variant p.Gln342Gln
C/T 5388642 synonymous_variant p.Leu368Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00287.1
MSSRENKSNILMQKYELGRLLGKGTFGKVYYGRSTITNQGVAIKVIDKNKVIKAGQVDHVKREISIMRLVKHPNVIELFEVMATKSKIYFVMEYAKGGELFKKVAKGKLKEDVAHKYFIQLVNAVDFCHSRGVCHRDIKPENILLDENDNLKISDFGLSALAESKHQDGLLHTACGTPAYVAPEVIKRKGYDGAKADIWSCGVVLFVLLAGYIPFQDPNLMVMYRKISKAEFTCPRWLPRGVRRLLSKMLDPNPNTRISIDEIKQCSWFRKWPNGIQTTQEGENRSVSPSITHHSEQYGDGSNGLAAEARQESVVPVSINAFDIISLSPGFNLCGFFEDSFQKREARFTSRQPASLIIFRLQEIANRLKMKIKKRAAGLLKLESLHEGRKGILSIDAEIFEVTPLLHLVEVKKSNGDTLEYEKILKEAIRPALKDIVWVWQGDQQQ*


CDS Sequence:
>Vu_00287.1
ATGTCTTCTAGGGAGAACAAATCAAACATCTTGATGCAAAAATATGAACTAGGAAGGTTACTAGGTAAAGGAACGTTTGGAAAGGTTTACTATGGCCGTAGTACAATAACTAACCAAGGTGTGGCCATTAAAGTGATTGACAAGAATAAGGTTATAAAAGCTGGGCAGGTTGATCACGTTAAAAGGGAAATATCTATTATGAGACTGGTGAAGCACCCAAATGTTATTGAGCTTTTTGAGGTCATGGCCACAAAGAGTAAGATTTACTTTGTTATGGAATATGCTAAAGGTGGGGAACTGTTTAAGAAGGTGGCCAAAGGAAAGCTCAAAGAAGATGTTGCACACAAATATTTTATTCAGCTAGTGAATGCAGTGGATTTTTGTCACAGTAGAGGTGTATGCCATAGAGATATAAAGCCAGAGAACATTCTGTTGGATGAAAATGATAATCTGAAGATCTCAGATTTCGGGTTAAGTGCCCTGGCTGAATCCAAACACCAAGATGGCTTGTTGCACACAGCTTGTGGAACACCTGCCTATGTTGCTCCTGAGGTCATCAAAAGGAAAGGTTATGATGGTGCAAAAGCTGATATTTGGTCATGTGGGGTAGTTTTGTTTGTCTTACTAGCAGGTTACATCCCTTTCCAAGATCCTAATTTGATGGTGATGTATAGGAAGATAAGCAAGGCAGAGTTTACATGTCCTAGATGGCTCCCAAGAGGAGTTCGGAGGCTATTGAGCAAGATGTTGGATCCAAATCCAAACACTAGGATTTCCATTGATGAGATTAAGCAATGTTCTTGGTTTAGGAAGTGGCCAAATGGTATACAGACAACACAAGAAGGGGAAAACAGGAGTGTCTCTCCTTCAATTACACATCATTCTGAACAATATGGTGATGGAAGTAATGGCTTAGCAGCAGAAGCAAGGCAAGAGTCAGTTGTGCCAGTAAGTATAAATGCCTTTGATATAATCTCCCTCTCACCTGGGTTTAATCTTTGTGGATTCTTTGAAGACAGCTTTCAGAAAAGGGAAGCAAGATTTACTTCAAGACAACCAGCATCTCTCATCATCTTCAGGCTGCAAGAAATTGCAAATCGGCTGAAGATGAAAATAAAGAAAAGGGCTGCCGGTTTGTTGAAATTGGAGAGCCTTCATGAAGGTAGGAAGGGGATCTTATCCATTGATGCAGAAATCTTTGAGGTTACTCCACTTCTGCACTTGGTGGAGGTGAAGAAATCAAATGGAGATACGCTGGAATATGAGAAAATACTGAAAGAAGCCATAAGGCCTGCTCTTAAAGATATTGTTTGGGTATGGCAAGGTGACCAACAACAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_00287::LG1:5384500-5386500(+)
CAGAGAATCTCGCTAGGGCCACTAGACTGCGCTGCAAAAGCATGGCGAGAGACAGTGCAAACTCCTCACATGGGCAGCGACAATAATATCTCTCGTGATAGCACAGTGTTATTGCTTCGTTGATTGGAATCAAGTATCAAAATTTAAGAATCGAATACGTTTCAAGGTTTATTTATATTATGCATGCCTTTAAAATGGTTGTGAAATTATAGAAATAGCACAAGGGCATATAAAACTTTTCGATATAAATCATTGCAAATCTTGGAAAAATTGCGAGATGCAAAAAATAGTAAAATCCTCGCAAATCCCTGCTTTTCATTCTTTGCAAATCAACGAACCGAACAACGTTTATCACGAAAATCTATCCTTGCTAATTCTCCTATACAATAAATAAGCGCAAGCGAACAACGTAAGAATTTTATTACTTTGTCTTAGTATCTAATGTGTTTGTTTTTCATAATATTTTATTATTTTAGAATATTCACAAAAAGAAATAATATAGTTTTTTAATTTTCTGAAAATGAATTTATACTGATTATGAAAAAAGTTAAAAATATTATTATAACAATAAAATAAAAGTTTAATGACTCGTATAATCCTCACTTTTGATAATAATATATTGAGTTGGTCTCGTTTTTTAAAATTTCAATTACATCCTAATTTTTTTAAAAATGTCTCAATTATATTTTTTTGAAAAAAAAAATACTAAAATTTTAAGAAAAAGATACTAAAGGCGTTAATAACATGTTACGTGTTAATTTGTGATGATTTTTAAAAAAAATTGTTTGTAAATTTTTTTATTGCTATGTATCAAGTTCATATGACATGTTGTACTTTCACTTTTACACGTTGACATGATATTGTTTGTTTTGATTTTAATTTAACTCTTATATTCCATCTCCAAATTGAGACAAAGTTTACTAAATGTTATACTAGTATTTTTATTAAAAATAATTTTCTAACCTATTGTATTATTATATATTATTAATTAATTTTTTGTTAATTAATGTTTTTTATAAGATTAAAACTAGTTAAATATAAATATTTAAAGAAAACAAGTATTTAAAATTAATATATTATTAATCCATGTTTTTTCAAAAAAAAATTAATATTATTTATATAAATAATAAATTTGGTTCTCTTTTAATTGACACTAAATTTATTATTTTTATAAATGTTATACTAATATTTATATCAAAGCTTAGTAATTAAAGTCATGATTAACAAATCATGGATTAATAACATACAATAATATAATAATAAGTAAAAAGTCATTTTTAATAAAAATATTAGTATAATATTTGTAAAAGTAATAAATTTTGTCTATTTTAAGAAAAAGAATTGAAACTAGATTGAATCAAAGAAAAATATTTAAAAATTAAATTGAAATCAAGATAATGATACTTAATATAAAATACGGACAATGTCATGTATTACACCAAAAACTTGATATGACAATATAAACATTTACAAAAAAATTTAAAAAATTACATGTAACATGTCATAAACGTCATTAATAATTTTTTTAAAAAAATAAATCTAATCAACACACTTTTACTAAAATTAAGACATAATTAAAACTTTTTTAAAAGTAGTCATAATTTGATACTCTACCACTATAGTAGGTATTGTATAAATAATTAAGCCTATAATAAAAGTGCCATTAATTCTAAGAAGAAAGAAAAGAAATATATCGATAATAAAAATGTACACCTTGAAAAGAAAGCCATAGGCTGAATTTGGTAACTTTTATGATGGTGTGTATCGGTTATTCGATCGAAATCAATCACCTACCTAAGCAACACGAGATCATCATGAGTGCCAACGTGTCAGTCACCATCCACCTGGCACAACATCATCAATTTTGCTTAGGTACACTACCATGACGTGGAAACTTCCAAATTCATTCCTTTTCCTCATGCATTAATGTCCGTACACGTGTTCGGCTACATTTCTCTGGTGATGGCACACCATGACATGAACAATTCCAAAACATTACA


Gene Sequence:
>Vu_00287(+)
AGAAATATCCATACTATATATGAATGTTGTATGCAAACAAGTAACAGCTCTAGTACTTACTAGTTAATTTATTTTTCTATACAACCACCGTACTATATCTCTACCATGTTTGGTGCTACAACTGTTCAATCTCAATTCTGAAGGTTTGAGGTTATTTTCATTTATTTATTATGGAGTTTTTGGTTTTATTTTATGCTTTGGATTGTGCTATTACACCAACATGTTTCTTACTATCTCACTATTATTTCAGCAACAAATTTCTCTTGCTAAAGATCAATGAATTACGTGTTTACTGTGAGGCTGAAAACATACATCATTTTCTAAGATCTTATAACTATACTACTGTCACTTTGTATTTATATGCGTTCAATGTGAAATCATTTTACATTGAACTGTAATATCTGCAACTGCCTTTCGTAATCAAATTTTTTACTTTTATGTTGGTTACAATCAGATAAGCTACTGTGACAGTCACTCTGTATGTATATATTTGAATTCAACTTATACCAAAGTATACTATCTGTCATGAACTATCAGAGCTATGATTAATTTTTTTTTTTGTTATTTATATATTATTTATACATATAAAACATTAGTTATTGAATCGAGTTTGATTCTTCTATGATTTTCAGACTGACTACATCGACAGGAAAATCATCTTCAATTTTCAGTATAGTTCTGAAGTTTGCTCAGCTATCTATGGCGCACATATATGTATATATTCTTCAACAGTGCATGACATAGCCAGAGAAAGAGATGCAGGAAAATGAGCTCTGTCTCTGAGATCCATAAGGTTATGTTCTTGCTATCACTGCCCAGCTTAATTGGTAACAGTGGAGAAAACATTGCTGGCTCAATCTTTCAGTATCCATTGATGCATAATCGGAAAACATGTTATTTTGATGTGCCTGTTGTGTTAGTACATCACCTGCGTGAAGACGGTTGAGTAGCTTATTTGCTATCATATAATCTCTATACTGAGTACATGATATAGATATTTTAATTGGCTGAAGGAGTGAAATTTTATTTTGCCCAACTCCAATGTCTTCTAGGGAGAACAAATCAAACATCTTGATGCAAAAATATGAACTAGGAAGGTTACTAGGTAAAGGAACGTTTGGAAAGGTTTACTATGGCCGTAGTACAATAACTAACCAAGGTGTGGCCATTAAAGTGATTGACAAGAATAAGGTTATAAAAGCTGGGCAGGTTGATCACGTTAAAAGGGAAATATCTATTATGAGACTGGTGAAGCACCCAAATGTTATTGAGCTTTTTGAGGTCATGGCCACAAAGAGTAAGATTTACTTTGTTATGGAATATGCTAAAGGTGGGGAACTGTTTAAGAAGGTGGCCAAAGGAAAGCTCAAAGAAGATGTTGCACACAAATATTTTATTCAGCTAGTGAATGCAGTGGATTTTTGTCACAGTAGAGGTGTATGCCATAGAGATATAAAGCCAGAGAACATTCTGTTGGATGAAAATGATAATCTGAAGATCTCAGATTTCGGGTTAAGTGCCCTGGCTGAATCCAAACACCAAGATGGCTTGTTGCACACAGCTTGTGGAACACCTGCCTATGTTGCTCCTGAGGTCATCAAAAGGAAAGGTTATGATGGTGCAAAAGCTGATATTTGGTCATGTGGGGTAGTTTTGTTTGTCTTACTAGCAGGTTACATCCCTTTCCAAGATCCTAATTTGATGGTGATGTATAGGAAGATAAGCAAGGCAGAGTTTACATGTCCTAGATGGCTCCCAAGAGGAGTTCGGAGGCTATTGAGCAAGATGTTGGATCCAAATCCAAACACTAGGATTTCCATTGATGAGATTAAGCAATGTTCTTGGTTTAGGAAGTGGCCAAATGGTATACAGACAACACAAGAAGGGGAAAACAGGAGTGTCTCTCCTTCAATTACACATCATTCTGAACAATATGGTGATGGAAGTAATGGCTTAGCAGCAGAAGCAAGGCAAGAGTCAGTTGTGCCAGTAAGTATAAATGCCTTTGATATAATCTCCCTCTCACCTGGGTTTAATCTTTGTGGATTCTTTGAAGACAGCTTTCAGAAAAGGGAAGCAAGATTTACTTCAAGACAACCAGCATCTCTCATCATCTTCAGGCTGCAAGAAATTGCAAATCGGCTGAAGATGAAAATAAAGAAAAGGGCTGCCGGTTTGTTGAAATTGGAGAGCCTTCATGAAGGTAGGAAGGGGATCTTATCCATTGATGCAGAAATCTTTGAGGTTACTCCACTTCTGCACTTGGTGGAGGTGAAGAAATCAAATGGAGATACGCTGGAATATGAGAAAATACTGAAAGAAGCCATAAGGCCTGCTCTTAAAGATATTGTTTGGGTATGGCAAGGTGACCAACAACAGTAATCACAACAGTTGGAGCAACTGCAGCAACAACAATCTCAGTCCCAAAAACATAATTTCTTAGTTTCCAGTGCCTCAAACCTTTGTGCATTAGGAATATGAAATGCCATTGTAAATGATGCTGTGCCTGTATATTTTCTTGTTCTTTACAATGCCATGACCTTATTGTAATACATAGAGTCTCAAATTTGACAGATGTTGAGTTTGAATATTTATGCAAGTTTACTGGTTAAACCGGTTGTAGTGGTAGTGGCTCAAAATGTTTTAAGGATGTGGGTGAATAAAGAGTGTGATACATACTGTCCTAAGAGAAATCAATAAATTGTGGAGTTTCTTTATC