Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_00162 LG1 3618012 3624179 PREDICTED: probable inactive receptor-like protein kinase At3g56050
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   protein phosphorylation, pollen tube guidance, pollen tube guidance, cell surface receptor signaling pathway, pollen tube guidance, pollen tube guidance, pollen tube guidance, protein phosphorylation, protein phosphorylation
Cellular Component   located in   chloroplast, chloroplast, pollen tube, plasma membrane
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein binding, protein binding, ATP binding, protein binding, protein binding, protein binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, ATP binding, protein kinase activity, protein kinase activity, protein binding, protein binding, protein binding, protein kinase activity, protein binding
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 3618067 missense_variant p.Lys673Asn
T/G 3618074 missense_variant p.Lys671Thr
T/A 3618214 missense_variant p.Glu624Asp
C/A 3618220 missense_variant p.Lys622Asn
C/A 3618251 missense_variant p.Gly612Val
A/G 3618775 downstream_gene_variant
C/A 3618889 missense_variant p.Met476Ile
A/G 3618916 synonymous_variant p.Cys467Cys
G/A 3619642 synonymous_variant p.Leu306Leu
C/T 3619872 missense_variant p.Gly229Asp
T/A 3619874 missense_variant p.Lys228Asn
T/G 3620039 downstream_gene_variant
G/A 3620067 downstream_gene_variant
A/T 3620120 downstream_gene_variant
C/A 3620457 missense_variant p.Trp131Cys
C/T 3620478 synonymous_variant p.Arg124Arg
C/T 3620506 missense_variant p.Arg115Lys
C/G 3620541 splice_region_variant&intron_variant
A/G 3620545 downstream_gene_variant
G/A 3620736 downstream_gene_variant
T/C 3620805 downstream_gene_variant
A/C 3621042 downstream_gene_variant
C/T 3621083 downstream_gene_variant
T/A 3621103 downstream_gene_variant
A/C 3621146 downstream_gene_variant
A/T 3621358 downstream_gene_variant
G/A 3621557 downstream_gene_variant
T/A 3621628 downstream_gene_variant
C/G 3621902 downstream_gene_variant
T/C 3621958 downstream_gene_variant
T/G 3622013 downstream_gene_variant
T/G 3622014 downstream_gene_variant
T/*,A 3622020 downstream_gene_variant
G/A,T 3622032 downstream_gene_variant
A/G 3622484 intron_variant
C/T 3622496 intron_variant
T/C 3622513 intron_variant
C/A 3622520 intron_variant
A/C 3622675 intron_variant
G/A 3622803 intron_variant
A/T 3622814 intron_variant
C/G 3622863 intron_variant
C/G 3622881 intron_variant
C/T 3622938 intron_variant
T/C 3623034 intron_variant
A/G 3623156 intron_variant
C/A 3623163 intron_variant
T/A 3623245 intron_variant
A/T 3623254 intron_variant
C/G 3623276 intron_variant
A/T 3623300 intron_variant
C/T 3623304 intron_variant
T/C 3623364 intron_variant
G/T 3623395 intron_variant
T/C 3623397 intron_variant
C/T 3623414 intron_variant
T/A 3623460 intron_variant
A/T 3623461 intron_variant
C/G 3623528 intron_variant
T/C 3623577 intron_variant
C/T 3623947 missense_variant p.Ala36Thr
A/G 3624043 intron_variant
C/T 3624052 intron_variant
G/A 3624071 intron_variant
G/C 3624090 synonymous_variant p.Leu30Leu
C/G 3624120 missense_variant p.Leu20Phe
C/A 3624141 synonymous_variant p.Val13Val
C/T 3624144 synonymous_variant p.Ala12Ala

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_00162.1
MALFSPLKLLPAVLALFLALSQKQSLCSTLESEGLALLALKESVVTDPQGALSSWSGENGDVMDPCSWFGVECSSHGNVVTLNLKDLCLEGTLAPEVGMLAHIKSIILRNNSFVGEIPEEIIYLQELEVLDLGHNNFSGSLPFDHGNMPSLTTLLLDNNYHLTNLTPELYKLKMNSEFRANEEQLTGATTTREAYVGRCSLWHIGQHGDRADRRQLLKVANVASTPKIQRHVNQGILKQLASHFPFALPPNFEPFSSPPSLSPSESPSYSPSPSPSDSFFTPSPSPSPVVLLTPDVSPPINTPLTVPTPPVNWVPAPSPSPFSTQGNTYNSNQIHHSAIIWSAVGGFSLLILMSAITFACFRSRKVVTVKPWSTGLSGQLQKAFVKGVPSLKRGEIEAACEYFSNIIGSLPDGTVYKGTLSSGVEIAVASSAVNTAQKWSKSMEAQFRNKIATLSRVNHKNFVNLIGYCEENKPFSRMMVFEYAPNGTLFEHIHIREAEELNWTMRMRIAMGIAYCLEYMHDLKPSIAHRNLQSSFIYLTEDYAAKISDLSLWNDMCAAKNGSATTQLLETSSADAKDNVYSFGIILFELITGKIPIAGNNDLLADWAAEYLRWGKSLRDVVDPRLNSLQEEEIEEWSEVMRNCVQPDREKRPTMKEVTSRLKEITAMGPDGANPKASPLWWAEMAITSTDSS*


CDS Sequence:
>Vu_00162.1
ATGGCACTATTCTCTCCGTTGAAGTTATTGCCGGCGGTGCTGGCTCTGTTTCTGGCGTTGAGCCAGAAACAGAGTCTCTGTTCGACGCTCGAGAGCGAAGGTTTGGCGCTGCTGGCGTTGAAGGAGAGTGTGGTGACAGACCCGCAGGGGGCTTTATCAAGCTGGAGTGGCGAAAACGGAGACGTTATGGATCCATGCTCGTGGTTCGGTGTGGAGTGCTCTTCTCACGGTAATGTCGTGACCTTGAATTTGAAAGACCTTTGTCTTGAAGGAACACTAGCACCAGAAGTTGGAATGCTGGCTCACATAAAATCAATCATTTTGCGCAACAATTCTTTCGTTGGAGAGATTCCTGAGGAGATCATATACTTACAGGAGTTGGAAGTCCTTGACTTGGGACATAACAACTTCAGTGGATCACTTCCATTTGACCATGGCAATATGCCATCCCTGACCACTCTTCTATTGGACAACAATTACCATCTGACCAACTTAACTCCAGAGCTGTATAAGCTCAAGATGAATTCTGAATTTCGTGCTAATGAAGAACAACTTACCGGTGCCACCACTACTAGAGAAGCATATGTTGGCAGATGTAGTTTATGGCACATTGGCCAACATGGGGATAGAGCAGACCGGAGGCAACTTCTCAAAGTAGCAAATGTTGCTAGTACACCCAAAATTCAAAGGCATGTTAACCAAGGGATACTTAAACAATTAGCATCGCATTTCCCTTTTGCATTACCACCAAATTTTGAGCCTTTCTCATCACCACCATCACTTTCACCGTCAGAAAGTCCCTCATATTCGCCATCACCTTCTCCCTCAGATAGTTTTTTCACTCCTTCTCCCTCTCCTTCGCCTGTAGTGTTACTAACTCCAGACGTATCACCACCAATAAACACTCCTCTCACTGTACCTACACCACCAGTTAATTGGGTTCCAGCACCTAGCCCTTCTCCATTTTCTACCCAAGGGAACACGTACAATTCCAATCAAATACATCACTCGGCGATAATCTGGTCTGCGGTTGGGGGTTTCTCTTTATTGATTTTGATGTCAGCCATTACTTTTGCTTGCTTCCGAAGTAGGAAGGTTGTGACTGTTAAACCTTGGTCCACAGGATTGAGTGGCCAGCTGCAGAAAGCCTTTGTAAAAGGTGTGCCAAGTCTCAAACGAGGAGAAATTGAAGCAGCTTGTGAATATTTCAGCAACATTATCGGTTCGCTTCCTGATGGAACTGTGTATAAGGGGACTCTCTCCAGTGGAGTCGAGATAGCTGTAGCATCCTCTGCTGTGAACACAGCTCAAAAATGGTCAAAAAGCATGGAAGCTCAATTCCGAAATAAGATAGCAACATTATCTAGAGTGAATCACAAGAATTTTGTGAATCTAATTGGGTACTGTGAAGAGAATAAGCCGTTCTCAAGAATGATGGTGTTTGAGTACGCTCCAAATGGAACACTCTTTGAGCATATACACATTAGAGAAGCAGAAGAACTAAATTGGACTATGAGAATGAGGATAGCTATGGGAATAGCCTACTGCCTAGAGTATATGCATGACCTAAAACCCTCCATTGCCCATAGAAACCTGCAATCTTCATTTATATACCTTACTGAAGATTATGCTGCTAAAATATCAGACCTTAGCTTATGGAATGACATGTGTGCTGCAAAAAATGGGTCTGCAACCACACAACTCCTGGAAACATCATCAGCAGATGCCAAGGACAATGTTTACAGCTTCGGAATAATATTGTTTGAGTTGATTACGGGGAAAATCCCCATTGCCGGGAACAATGATCTTCTTGCAGATTGGGCAGCAGAATATTTAAGGTGGGGGAAATCCTTGAGAGATGTTGTGGATCCAAGACTGAACTCTTTGCAGGAAGAAGAGATTGAAGAATGGTCTGAAGTGATGAGAAACTGTGTACAACCAGATCGAGAGAAAAGGCCAACTATGAAAGAAGTTACATCTAGACTCAAGGAAATAACAGCTATGGGGCCTGATGGAGCAAACCCAAAGGCATCACCACTTTGGTGGGCAGAAATGGCAATTACGTCCACTGATTCAAGTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_00162::LG1:3624179-3626179(-)
CTTTGATTATAGGACATTTGTCACTTACAAGACGCAACCATTTTTTTGACTTAATATGAAAATAAAATGTTTTAATATGTGTCTTCTACATGCATGAAAATAATATGTTCAACAACACATTATAGTTTGTGATAAAATTTTAGTAGTTTATATAATGCGGTTCGACCATGAATCAATTATATAAGAGATTTAACATTATTTTCAATTAAAAATTTTAATAATATGTTTGGATAACATATTTTTAAAATTTGAAATGCTTTATGAAAAATATGTTATTTGGATAGAGAATTTTGAAAAAAAAATTGAAATTCTAGAATTTTATTAGAGTAATTGATTTACTTTAAATTAAATAATTTTAAATTTCATTTTAAAATATGAATTTAAAATTTTTCACATTCTTAAATTCATATTTGGATTTTTGTAGTTAGGATTAACCTAAGTTTGGATCGATTTGACTCAGTATGATGTGTGATTAACTTAATTTAGTTTGATATAACCTCAATTCAATATCTCAGTCCAACATTAGTTCAACTCAATTTGGTCAAATCTAAATAGATTTGTCTCGGTTCCACCTACATCTAATGTGATGTGGACTCACCCTAATTAAATTCAACCAAATTTGATTTGATTCGATATGGGCCAAGCCCAACTCAATTAGTGTGATTCCACCTCAACTCAGCTTGACTTGAGCTTAAGTTGACTCGACTCAATTAGCCTGATTAAACTCGGTTCGATCTAGGTCCAAATTGACTTGATTGTACCAACTCGGGTCGATTTAGTTCGACTAAGCCCAAACATACTCAAGTCAACATATATCAATTTTAACTCAATCAAACTTTGGTAGAATAAACTTAACCGTTTCAAGATGATTCAACTTGACTTAGGTCTAGATTGACTCAACTCAACCAAATCTTGACTGATTTAATTCAACTAAATCTGAATCAAATAAGCTCAACCTATGGCTAAAGTTAACTCAAATCGAATTGATTTGAGTTCTTTTAACTTAACTAACTTAAAATGTCTAAACTGAATGAAGTCTAGCATGACTAGCTCAAACTCGATCATGCATAAAAAAAATAATATAATATGATTTATGTTAGAATTTTAGTATTATATAAAGAGTTTTTAACCAGAATCAATGAAGACTTTATCTCTTCCCATCAAAACCTTCGAGGGATTGTAAGCCTTTTTTCTTCGTATATTATCTCATCTTTACATTGCATTACTCTACACTTCACATTTAAATTTCTCGTAATTAGATTTGTAATTTTTTTATGTATTACTTATCTTACTCATATTTATTAATATAAAAAATCCTAACTTCACACTTAAATTCTCCATTATCTTCCTCTCAAGTAAATCTGGACACATTATAAACTTTTATTTCACCTTAAAAGTGTTTTATCTATGAATCGTTTATTCATATAAACTTTTCATAAATAATGTCAATTGTTAACATATTCCACAATACAAAAAGAAAAATAAAATAACAAATAACAGGATAAAATGTCTTACTTTTTATATTATAATAATTTTGTTTAATAGACGGTTGGTCGAACTAACAAACCGGTGACTAAACCCTTTAATCGGTTCAACCTAAGTAGACTTTATTGTAGCCATTCAGTCTATGAAATTTAATTTTAAGCATTTGTCTGCAGCTCCGAATCACTGCAAACCAATATAGTAGGATGCTGACAAGTAATTAAAAAAATTACATGATTCATATTTAGCATTATAATGAATTAAAAAACACTAACAAATCTTTTTTAACATCAATGGCTAATTAGCTAATGACAGGATTTGGACGTTTTACTTGAAAAAAAAATGTATTAATAATTGTCATAAAAAGTAGATCTTAATTATATTAGATAAACATTACTACTATTATTGTGAGCATGGTGCTGTTGTATATATATATATATATACCACACTCATTCTCTCTCTAAGTCCCTTCTCTTTCTCTTGACCAGAACGGTGAATAATTTCCTTCATCATCTCAC


Gene Sequence:
>Vu_00162(-)
ATGGCACTATTCTCTCCGTTGAAGTTATTGCCGGCGGTGCTGGCTCTGTTTCTGGCGTTGAGCCAGAAACAGAGTCTCTGTTCGACGCTCGAGAGCGAAGGTAAATAACGGTGGTTACAGAAACGACGGCGCTGAGTGGTTGTTTTTTGTTGAGCGAGTTTTCGGTGATCGGAAGTGGAGGTTTTGGTTAAGTTTACGAAACGGCGTGTCGTTTTGCTGGCGCAGGTTTGGCGCTGCTGGCGTTGAAGGAGAGTGTGGTGACAGACCCGCAGGGGGCTTTATCAAGCTGGAGTGGCGAAAACGGAGACGTTATGGATCCATGCTCGTGGTTCGGTGTGGAGTGCTCTTCTCACGGTAATGTCGTGACCTTGTAAGTAACCTCTCTTCTCCTCTCTTTTGTCACGTTTGTAAAAAAAAAAATAAAAACAATTATGGATTATTAATTTTCCTAATAATTATTTTAAAAGTTGTAATTAAAATTGAATTAGTTAATGTAGCAAATTCACTCGCAATGCCATTACAATTTCCAATGTGAAATAAAACTGATTTTGTTAAAAACTTTTCGTCTGTTTTGAAAATGACTGTTAGATAATTCTGAAAGTAGGATAGTTTATAGAATTCTTTTGCTCTGGATGCGATAATCAAATATTTGATTTGAAACCAAAATAGTAATTTCATTTTTATCTTTGGGAATGATAAGTGGTAAAAAGATAATTAATAAAATCGATGAGAGAATTAGAGGAGGTGTCAGTAATCTCAAGTGTGGCATGAAACTTGCGTTTAGCTTTATTAAACATGAAATTGAATAGTTTGGTAACTTTGTGTTTGCCACTGTTTTAAGCCCTCTGTTTTATAATGAAGAGAGGGGTCCATTAGCCTTTGATTTTGGTATTAAATTGGCCGGCAGAGAAACCTGGTCTTCTTGTAGTGGTAGAAGCTGTTGTTCTTCTGATAATGAAAATGGAAAATGATATACAAGATCTTCTTAGCTCAATAACTGCAACTTCTATTCTTTAGAAACCTTTTTCAAAATTTCCTGCCACCTGTTGTGAGGAAAATGACATAATTAGTAAAAGGAATTTATATATAACGCGTTCAGGAATTTAAAAGCAACTAAAGAGGAGAAAGAAAAATTAACAATGATTAGTAAATATTATTTTATTGGTTGAAGTTTTGTAAGTTGATTTCTTCATGCGACAAATAAGTAAATAATTATACTTTAAGGTAATTTAAAAAATATGGACAAAAATAAAGTAAAAGACTATTATTTATTATTAATAAGTATAAAATTAAATGTTGATTTATTTCATGATTAAGTAATTCATTCTTTTAACTTTCATTTATATTACACTTTAAGGTAATTTTTAAAAAATATGCACAAAAATAAAGTAAACGACTTTATTATTTATTATTAATAAATATAAAATTAAATGTTCATGTATTTCATTCATTCTTTTAACTTTCGCTTATATATTATGTTATTATACTATAATTATATAAAATATTTTAAAAAGATAATGTTATTGTTTTGGGTATGGGTTATGACCAGAATACTCCATTTTACATTGTTTTTTATCCAATTTCTAATGTTGTCTCTAAAGTTGGAGTTACTCTATTCTCTAAATAATTATAACTTTTAATCACATATTTATAAGTTTCGATATAAATTTATAATTAACACAGGTTTAATCATGATCTAATAAAAAATAAATATACTTTGTTTATAAATTTGATCATTAATGACATTTAAATTTTTTTTATCAAAAGACCAGTTCCAAAACCTCACCAACCAATTGATAGGAGGTAAGGAGATGGAATGCTATGACACAATCTCTAAAATAAATCATTCCGTAAATAACTAACTAGACTATCATACAATAAAATTATTATTCACAAAAGTTATCAAGTTTAATTTGCTTTTATTGATCCTTCATCTTTGATATATCTTCCTCTCTTATCATTCAAGCTTAAAAATATTTAAAGAATGTACATTTATCATTTACTTTTTTTTTTATTTTTCTTTTATAATGAAACTATGAGTTAAGAGTAGAATCAATTATTTAAAAATTACAATTTATTTAATAATTATAAAACATTAAAAATCATATCAGTACTTTTTTGTATGTTAAAGAATATATAATAACAAACATATTTACATAAAAGACAATTTTAAATATATTTAAGTACTAAATATTACAATAACAATTATTAATTTTACCAAAGAATTTTGATACATTTACTATAACATCATATACATCATACTTCTTTCAATAGTAAGTTTTATTAATTATATTTCTTTTAATAAAAAATGCTAGTGATTATGGCATAAAAATATATTAAATTGAAATAAAATATATTACTTCCAAATATTTGAATATTAAGTCATTTTATTGAAGAAAGATTTATTTATAATTTTTTAAATTGTAACAAAATTATAAAAGAAAAATAACTATTAGGAACAGCGATAAATGACACTGATATTTTATATAAAATAAAAAATATAATTATCTGTTAAAAAATAGAATGTTTACAAAAAAAAATAGTTAAAATAATTATTTATGTGAATTAACTTCTTATCTAAAATTATTACATTTGTGTGTAAAAAATAAAAAAGTCAGGGGGCCCTTGGTTGTTCCTATCTAACCTGTAAAAATTTACTTTGATTTTAATTTTAATATTCTAAAATTAGTAATTTTATATATTTTTTTATAATAGAATAGATCTTCATTTTGTAAAATGTTATAAGATGATATGAATGTCAGTTCTCAAAGTGAATAAAAATTTACAAAAATCAAAGTTTGAGTTATTTATTTATTTATTTTTTTGTAAATTCAAGGTCTAAAATGAAAAATATGGCCAACCTTTCAAAATACTTTGTCAATGCTGAACCTAATAATTTTATTCTATTTGATTAAGTATACCTGTTTGGTCGGATTTGGTATTTTACTAAAAAACAGTATTTACTTGAAAATGAAGTATAATGAGTTAGTGTTAACAAGGCAACCTATCAAAAATTAAAATATTTTTTAATAATTACATATTTATTGTTTATATGCCTGTAATAATCTTTATTATAACTTTGCTTTTCCTTAGAATGCACGTACATTTTGAATATTCTTTTATAAATCAAGGAAATTTTATAAATATATTTGTATATAAAGAAAAATAAAATGTTGCATGCTTTTTTTTAAGGATAACAAACTCTATAGTTCTCTAATTAAAAATAGCCTTATTATAGTTTAAAAACGATTATTTAGATCCATGTAGTTTTCATAATTGCAAAATTTCATATTTCTTTATGAACATGCATGAAATTATTTACAATAAAATGAATAAATAAATAATTAAATAAAGAACAAAAATCACCTTTTTAAAAGTGTCGGGGTGAGGTCAATGTTAACCAAAAACAAAGAAATTTAAATCACATTTTTCTACCATTAGTGCGCGATAAAACATACAATTAATACTGGTGACGAATATTCAACTTGCAGGAATTTGAAAGACCTTTGTCTTGAAGGAACACTAGCACCAGAAGTTGGAATGCTGGCTCACATAAAATCAATGTAAGATGGTGCTCATGCCAATGCTTGTTTTAGAAATAAGAATTCCTCGACCAACTTTGTACACTTTGTATTCTCGGCAGCATTTTGCGCAACAATTCTTTCGTTGGAGAGATTCCTGAGGAGATCATATACTTACAGGAGTTGGAAGTCCTTGACTTGGGACATAACAACTTCAGTGGATCACTTCCATTTGACCATGGCAATATGCCATCCCTGACCACTCTGTAAGTTAAGCCTTTCATGCCAAATATTTTCTTTCTGTCTTGTTCTTTGGTTGACTAATACTGCCAAATTTATACTACAGTCTATTGGACAACAATTACCATCTGACCAACTTAACTCCAGAGCTGTATAAGCTCAAGATGAATTCTGAATTTCGTGCTAATGAAGAACAACTTACCGGTGCCACCACTACTAGAGAAGCATATGTTGGCAGATGTAGTTTATGGTAAGCAAATAATGATGGATTTTACAAAACAAATTTCTGAGTTATCAATTTTAGAATTTGTATTCGATGAACATCTTCCTCAGTAAATGGCTAACGTAGCCCTACAATGAAAATAATCATCAGACCAATATTGCTAAAAGCGTGCTTATTCATTGTAAAGTTCATCTACAGTTCAAATTTGAAATTATTTGCTTGTGACAATTTTGTCTAAGGCACATTGGCCAACATGGGGATAGAGCAGACCGGAGGCAACTTCTCAAAGTAGCAAATGTTGCTAGTACACCCAAAATTCAAAGGCATGTTAACCAAGGGATACTTAAACAATTAGCATCGCATTTCCCTTTTGCATTACCACCAAATTTTGAGCCTTTCTCATCACCACCATCACTTTCACCGTCAGAAAGTCCCTCATATTCGCCATCACCTTCTCCCTCAGATAGTTTTTTCACTCCTTCTCCCTCTCCTTCGCCTGTAGTGTTACTAACTCCAGACGTATCACCACCAATAAACACTCCTCTCACTGTACCTACACCACCAGTTAATTGGGTTCCAGCACCTAGCCCTTCTCCATTTTCTACCCAAGGGAACACGTACAATTCCAATCAAATACATCACTCGGCGATAATCTGGTCTGCGGTTGGGGGTTTCTCTTTATTGATTTTGATGTCAGCCATTACTTTTGCTTGCTTCCGAAGTAGGAAGGTTGTGACTGTTAAACCTTGGTCCACAGGATTGAGTGGCCAGCTGCAGAAAGCCTTTGTAAAAGGTAATTTATGTTTGCTATAGGTCATTCTGCATCTTATGTACTACTGCATAAAGATTAAGAATAAATTCAATTTCAAAATGCATTGTGAATTCAAAGAATGAAGTTAGTTTTTTAGAACTATTTCTTTAGCTCGGATTGAGTTAACTTATTATTATGCGTTATTAAGGTGTGCCAAGTCTCAAACGAGGAGAAATTGAAGCAGCTTGTGAATATTTCAGCAACA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